Lidé s opačnou sexuální orientací, transvestité i transexuálové čelí v řadě členských států Unie nerovnému zacházení. Problémy se vyskytují především v zemích mimo starou EU15 – včetně Česka. Osoby patřící ke zmíněné minoritě jsou diskriminovány při shromažďování, vzdělávání, zdravotní péči, hledání zaměstnání nebo ve sportovních klubech.